您入职11个月公司扣绩效工资，存在以下特殊情况会影响处理结果：
1. 公司规章制度违法：若公司扣绩效依据的规章制度未经过民主程序制定（如未召开职代会讨论）或未公示/告知您，该制度无效，您可主张公司全额补发绩效工资，此时扣发行为不具有合法性。
2. 绩效扣发与实际工作无关：若公司因您未完成与本职工作无关的任务（如强制要求销售产品）扣发绩效，属于违法扣发，您有权要求补发，因为绩效考核应与岗位职责相关。
3. 公司恶意扣发：若公司为逼迫您离职而无理由扣发绩效，您除了主张补发绩效外，还可依据《劳动合同法》主张经济赔偿金，此时处理结果会涉及额外赔偿。
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您入职11个月公司扣绩效工资，可能面临以下法律风险：
1. 诉讼时效风险：若您知道公司扣绩效工资后未在一年内申请仲裁，将丧失胜诉权。例如，您2023年1月发现2022年12月绩效被扣，2024年2月才申请仲裁，仲裁委将驳回您的申请。
2. 证据链断裂风险：若您无法提供劳动合同、工资条或绩效评估记录，将无法证明公司扣发绩效的违法性。例如，公司称您绩效不达标但未提供评估记录，您也无法证明自己绩效达标，将难以胜诉。
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针对您入职11个月公司扣绩效工资的问题，其法律依据主要来自《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应依法建立完善劳动规章制度，涉及劳动报酬的制度需经职代会或全体职工讨论、平等协商确定，并公示或告知劳动者。您入职11个月，若公司扣绩效工资依据的规章制度未履行上述民主程序或未告知您，则该制度对您无约束力，扣发行为违法；若劳动合同明确约定了绩效计算方式，公司未按约定扣发，也违反了合同约定。综上，公司合法扣发绩效的前提是有合法有效的制度或合同约定，否则您有权要求补发。
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您入职11个月被公司扣绩效工资的计算方式，核心取决于劳动合同约定与公司合法有效的规章制度。下面为您分情况详细说明：
1. 若劳动合同或公司规章制度明确约定了绩效工资的计算标准（如按业绩指标、考勤等），且扣发符合该标准：则按约定的计算方式扣除后发放剩余绩效工资，例如约定“绩效工资=基础绩效×业绩完成率”，业绩完成60%则按60%计算发放。
2. 若公司扣发绩效工资无合同或制度依据，或依据的制度未依法制定公示：则扣发行为不合法，您有权要求公司全额支付被扣的绩效工资。
3. 若公司以“绩效不达标”扣发，但未提供经您确认的绩效评估记录：则扣发缺乏事实依据，您可主张公司补发绩效工资。

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